بعد
العام 2012م
استحدثت دوائر عامة لرعاية شؤون الطوائف التي يمثلها الديوان، وحسب
قانون ديوان أوقاف الديانات المسيحية والأيزيدية والصابئة المندائية
الجديد، والحق بكل دائرة قسم لتنفيذ المشاريع الخاصة بالطائفة في كل
محافظات العراق..
في بداية العام 2009م
انقسم
تنفيذ المشاريع التي يشرف عليها ديوان أوقاف المسيحيين والديانات الاخرى
حسب المديريات العاملة في الديوان ويتبع كل قسم منها الى مديريته.
حيث كان في السابق يتم
تنفيذ الاعمال والمشاريع تحت اشراف القسم الهندسي في الديوان. والآن
يقوم القسم الهندسي باعداد التصاميم والكلف التخمينية ودراسة الطلبات
المقدمة من قبل الجهات المستفيدة من المشاريع..
الطوائف
المسيحيـــــــــــــــــــــة:
الكنائس الكاثوليكية
الكنائس الأرثوذكسية
الكنائس الآثوريـــــــــــــــــة
طائفة المشرق الآشورية
الكنيسة الشرقية القديمة
الكنائس الأنجيليـــــــــــــــــة
الكنيسة
الأنجيلية الوطنية البروتستانتية
الادفنتست السبتيين
الطائفة الايزيديــــــــــــــــــة